Bifore Crisis se passe 6 ans avant le premier opus de Final Fantasy VII. La guerre entre les Turks et la tribue de Wutaï est sur le point de ce terminer. Cette nouvelle victoire des Turks ne fait qu'affirmer la domination et la puissance dans le monde de la Shinra, que se soit d'un point de vu économique, militaire et politique.

A l'époque, les Turks, agents de la Shinra, régnaient sur la ville de Midgar. Un groupe nommé Avalanche ( constitué essentiellement de Elfé, Fuhito et Shers ) lutte contre l'entreprise Shinra portant le nom "Shinra Electric Power Compagny" et tente de la réduire à néant. L'entreprise à recruté de nouveaux membres au sein des Turks pour lutter contre cette oganisation terroriste. Ces agents sont chargés de retrouver les membres de Avalanche afin de mettre fin à la résistance.